ThunderbirdというOutlook Expressライクなメーラーがあるようです。フリーで利用できるようですが、インストールしてぱっと確認したところ。。。。
1.自動返信の機能がない
→教員が授業管理用として利用するには不向き
2.プロファイルの中に設定情報が書き込まれる
→自動復元の仕組みを組み込んでいるPC教室では、毎回設定が消えてしまう
※確認した範囲では、%AppData% の中(C:\Documents and Settings\ユーザー名\Application Data の中)に保存されるようです
自動返信の機能があって、なおかつ実行プログラムと同じディレクトリに設定情報が保存されるようなメーラーって何かないのかなぁ。